Отделение организовано в 1934 г. Основателем отделения и заведующей была к.м.н. К.Ф. Гришина, которая возглавляла его до 1953 г. В дальнейшем заведовали отделением: проф. Коган Д.А. с 1953 по 1971 г., с 1973 по 1995 г. - Л.И. Сая-1 дина. С 1995 по 2017 г. - С.П. Юлдашева. С 2017 г. заведующем отделением является Д. Ш. Аскарова. 

Первые послевоенные годы отделение занималось восстановительным лечением инвалидов Второй мировой войны с болезнями культей и остеомиелитом, а также ортопедических больных. В дальнейшем, в связи с изменением Структуры института, физиотерапия в сочетании с массажом и ЛФК находит широкое применение при травмах, а также заболеваниях опорно-двигательного аппарата, в том числе, ряда тяжелых ортопедических деформаций у детей врожденного и приобретенного характера. В настоящее время основное внимание уделяется послеоперационной реабилитации больных ортопедо-травматологического профиля.